經過二十幾年來的研究，在早期魚苗用配合飼料之開發上雖有進展，但能完全取代餌料生物的人工飼料，仍是一項最重要且具挑戰性的研究課題。尤其作為海水魚苗初期餌料用的海水輪蟲，自1960年開發確認為必要的餌料生物以來，迄今仍未找到更好的替代性種類。因此餌料生物生產在種苗培育上是不可缺少的一環。在歐洲一年產三千萬尾2g 鱸魚苗的公司員工54人中，餌料生物生產佔11人即為例證，此事例也彰顯現行餌料生物生產系統有大量人力需求的缺點。因此利用自動化、流程控制原理測試大量培養系統之效能；利用圖控軟體，以壓力整合濁度恆定藻類反應器組，生產等鞭金藻及擬球藻；建構連續生產循環培養系統，培養浮游動物等，為近來探討的課題。

　　在台灣，餌料生物的生產模式，目前多仍停留在戶外、大面積，以魚漿、飼料、雞糞作水的方法培養。因受天候之影響，產量難以期估，且近年來病害嚴重，有時餌料生物亦成病菌之帶源者。室內高密度生產模式雖然可以預期，卻仍有技術層面的需求，以及為達可控制所必需投入之設備，故在家庭式的經營模式難以接受。但能適時、適量、提供質優餌料生物的穩定生產方式，將為未來發展的趨勢。本研究即在於進行餌料生物期約量產之成功信賴度，生產成本及實際用於育苗之得失，與經濟性評估試驗，作為種原庫建立及運用之修正，並繼續種原的收集與保存，資訊建檔及種原提供。

　　目前本所保存的餌料生物種原有微藻33種56株，輪蟲3種9株，海水橈足類1種。其中東港等鞭金藻、牟氏角毛藻、骨藻、擬球藻、扁藻等微藻及輪虫已被充分利用，且提供業者實際應用於石斑魚、白蝦、牡蠣之種苗繁殖產業上。88年度取用種原人數達297人次，大多數係索取微藻，共有285人次，以1~3月取用數較低外，其餘月份均在20人次以上。大量培養純化保種之扁藻、牟氏角毛藻、東港等鞭金藻及輪蟲，提供作為草蝦苗之餌料，以取代有病毒感染疑慮之骨藻，結果顯示蝦苗培育至後期幼苗第一期，二者之活存率無顯著差異，且經PCR檢測結果均未受到WSSV感染，建立無病毒蝦苗之餌料生物生產系統。

　　種原資訊建檔及完成參考手冊之編著：出版包括微細藻、輪蟲、豐年蝦特性、餌料生物營養價及培養等課題之「餌料生物之培養與利用」及「餌料生物生產系統」2本推廣手冊，提供業者參考。

　　餌料生物生產系統連同魚苗培養設施，設於水試所東港分所餌料生物館的一棲及其戶外(北側及西側)，基地 40m x 15m。大部份飼育槽為FRP桶，室外計有微藻培養池500公升24個，250公升12個。室內有徽藻培養室(6 m x 10m)，輪蟲培養槽500公升8個，豐年蝦孵化暨滋養槽500公升4個，魚苗池200公升21個，3,500公升水槽6個。徽藻培養室內有培養用水處理設施，壓克力培養槽120公升12個，培養木架二座、溫度控制及照光強度與時間控制。這樣的微藻設備，最高可連續提供東港等鞭金藻(或牟氏角毛藻，或周氏扁藻) 6000公升/日，或擬球藻4000公升/日，或四種各1000公升/日。在每日供應藻1000公升條件下，使用8個500公升水槽，每日可收穫1000公升水量輪蟲;部分再作種原，可淨生產輪蟲0.6~3億隻/日，提供10~50噸魚苗池水量淨輪蟲數5隻/ml/日。

表1 收集之餌料生物類別

Phytoplankton

Cyanophyceae Synechococcus sp. 聚球藻 5 strains

Chlorophyceae Ankistrodesmus convolutus 卷曲纖維藻

Chlorella spp. 小球藻 8species (strains)

Chlorella ellipoidea 橢圓小球藻

Nannochloris oculata

Oocystis borgei 波吉卵囊藻

Prasinophyceae Tetraselmis sp. 扁藻

Tetraselmis chui 周氏扁藻 2 strains

Tetraselmis subcordiformis 亞心型扁藻

Tetraselmis suecica

Tetraselmis tetrathele 四鞭扁藻

Haptophyceae Dicrateria zhanjiangensis 湛江叉鞭金藻

Isochrysis galbana tml 東港株等鞭金藻 2 strains

Isochrysis galbana 美國株等鞭金藻

Isochrysis galbana 3011 中國株等鞭金藻

Isochrysis aff. galbana 大溪地等鞭金藻

Pavlova viridis 2 strains

Pavlova salina 鹽生巴夫藻

Eustigmatophyceae Ellipsoidion sp. 2 strains Nannochloropsis oculata 擬球藻 2 strains

Bacillariophyceae Chaetoceros mulleri(gracilis) 牟氏角毛藻 2 strains

Skeletonema costatum 骨藻

Thalassiosira wesifolii 魏氏海鏈藻

Dinophyceae Alexandrium minutum 小亞歷山大藻 8 strains

Prorocentrum lima 利瑪原甲藻 2 strains

Zooplankton

Rotatoria Brachionus plicatilis 壺形輪蟲L型 2 strains

Brachionus rotundiformis 壺形輪蟲S型 2 strains

Brachionus sp. 壺形輪蟲SS型 5 strains

Cladocera Diaphanosoma aspinosum 缺刺秀體水藻

Copepoda Apocyclops royi 短角異劍水蚤