- 本會於93年9月20日舉辦成立20週年慶，陳總統與行政院游院長親臨與會，陳總統致詞時宣布設立「農業部」及於明年設立總統農業獎，每一位獲獎人可得獎金100萬元，本會正積極推動辦理，預定於94年2月4日農民節由 總統親自頒獎；游院長也強調農業應朝向「生技農業、觀光農業、行銷農業」3大主軸，及落實推動「一院、雙金、三館、四項旗艦產品、五個園區」的農業發展計畫，打造升級轉型的台灣新農業，將台灣農產品推向國際舞台。
- 為積極推動入侵紅火蟻防治工作，本會於93年9月3日召開跨部會紅火蟻防治會報之籌備會議，決議成立跨部會緊急防治會報，推動緊急防治行動計畫及各縣市成立緊急防治工作小組，並請各部會及縣市政府增列防治經費及人力。另於9月14日第4次召開跨部會研商共同推動入侵紅火蟻防治工作會議，由各單位提報入侵紅火蟻防治辦理情形，並請各單位依督導權責分工確實監測防治及推動宣導，並落實偵測及疫情通報，以有效控制其發生。本會於10月1日於桃園縣擴大辦理入侵紅火蟻防治示範觀摩會，積極投入監測防治紅火蟻工作，並加強宣導措施。
- 台灣地區9月份受艾利颱風、0910水災及海馬颱風侵襲，造成農林漁牧業損失約9億元，農業公共設施毀損之搶修與復建所需金額9.6億元。其中艾利颱風農林漁牧業損失約8億元，農業公共設施毀損之搶修與復建所需金額9.2億元；0910水災及海馬颱風農林漁牧業損失約1億元，農業公共設施毀損之搶修與復建所需金額0.4億元。
- 為減輕農（漁）民貸款償付之負擔，改善農家財務狀況，於93年9月20日推出「改善財務貸款」，總額度為120億元，目前農貸利率在年息7％以上者，特獲調降為3.5％；另為協助農（漁）民籌措家計、消費及教育等所需資金，改善農（漁）民生活，於同日推出「農家綜合貸款」，年利率為2％，總額度為100億元。
- 全國農業金庫籌備處業於93年9月6日召開第一次發起人會議，會中除報告籌設進度外，並共同商定全國農業金庫組織架構及公司章程，另外為利該金庫籌設工作進行，由農漁會界推選五位發起人代表，參與日後籌備會議及籌設工作。
- 本會為鼓勵農民種植高品質稻米，建立品牌知名度，於93年9月10日辦理「第一屆全國稻米品質競賽」，經過評審，選出全國十大冠軍米得獎人及鄉鎮，並於9月24日在板橋市農會舉辦之「第一屆全國稻米品質競賽頒獎典禮暨全國冠軍米競賣會」辦理拍賣，池上冠軍米以每公斤六千元高價賣出，美濃米以每公斤五千元價格居第二。
- 為紓解近二年來國內化學肥料價格調漲對農業生產成本的衝擊，行政院核定自93年9月1日起，辦理化學肥料運費補助，每公噸補助250元，並反應於末端售價，即每包（40公斤）調降10元。降價幅度因肥料種類不同，約在2.5-6%。截至9月22日止，已有國內25家主要化學肥料製造及輸入廠商完成簽約手續，承辦此項化學肥料運費補助計畫。
- 現行之「漁業動力用油優惠油價標準」第四條之規定，係於92年8月27日經行政院完成修正公告，其相關優惠油價之補貼標準，係採「固定金額」方式進行補貼，並以93年8月31日為分隔日期，分二階段逐步調降補貼金額。惟因國際油價高漲，漁業經營陷入困境，案經行政院於93年9月7日核復略以：延長第一階段（至93年8月31日止）之補貼措施，原則同意，即每公秉甲種漁業動力用油仍補貼1,319元，乙種漁業動力用油補貼1,165元，惟終止期限仍請配合第二階段期程妥慎研議，再行報院。
- 為配合「有效控制農產品走私」，本會製作相關宣導短片或節目，並運用大眾媒體向民眾進行宣導愛用國產農產品，拒絕來路不明之走私產品。另本會亦提供關稅總局優先查緝走私農產品項目清單、辨識方法、建議加強查緝地點等資料，請海關加強查緝走私進口農產品。
- 為加強動物保護宣導及呈現動物保護成果，本會將9月訂為「動物保護月」，93年度「動物保護月」系列活動自9月1日起陸續推出，除舉辦「寶貝家族忘年會」外，並辦理動物保護攝影比賽頒獎及「2004動物保護公共論壇」等多項活動，就各種層次及角度宣導，以增進全民動物保護之觀念。
- 為防範狂犬病入侵，本會於93年9月份發動全國各縣市政府同步實施狂犬病預防注射，各縣市除舉辦各項宣導活動外，並提供相關優惠措施，呼籲家中有飼養犬、貓等寵物之民眾，均應攜帶所飼養之寵物接受狂犬病疫苗注射，以維護飼主及寵物安全，並保障全民健康。
- 本會與亞洲生產力組織（ＡPO）於93年9月20日至25日在本會農業試驗所聯合舉辦「永續之有機農業」國際研討會，除與亞太各國切磋農業發展經驗外，並引領各國代表參訪我國有機農業的永續發展，讓各國代表體驗台灣農業發展的奇蹟與成就，彰顯台灣的農業國際地位，爭取更多國際奧援。
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