為落實推動農業科技創新研發成果運用與商品化產業化發展，本會於 2014 年 1 月 1 日成立農業科技產業化當責機構「財團法人農業科技研究院」（簡稱農科院）。農科院設立宗旨係為農民、農民團體及農企業提供農業技術、商品化及產業化服務，加速發展農業新創事業及國際化；農科院依整體業務發展所需，設置植物、水產、動物共 3 個科技研究所，及產業發展中心與總管理處等單位。農科院設立之任務為承接試驗研究機構之研發成果，或與該等機構合作將研發成果進一步加值運用，包括量產技術開發應用、標準規格訂定、實用性評估分析、智財保護與布局、品牌設計及市場行銷等，並輔導承接，進而商品化、事業化、國際化，期達成「打造農業科技產業成為臺灣創新產業，帶動農企業與農民合作開創全民農業」之農業科技施政目標。

　　本會依據全球市場、產業需求及我國農業利基之指標，自 2014 年至 2017 年，選擇 10 項具國際競爭發展潛力的農業科技亮點產業，以農科院為運籌平臺，推動農業科技研發成果加值運用與全球布局。 2014 年選定 6 項具國際市場潛力的重點產業，包括動物疫苗、飼料添加物、生物農藥、石斑魚模場、檢測檢驗技術、觀賞魚與周邊產品等，採「產業出題、學研解題」模式，整合產學研力量，透過產業發展策略分析、農業育成整合、關鍵技術產業化應用、產業加值策略、智財布局策略、委託研究服務全球接單、科技農企業輔導及國際化行銷與人才培訓等 8 項策略，強化產業競爭力，帶動市場商機，推動農業科技產業發展；同時提供對產業界之育成輔導，並引進技術、資金及廠商，投資或與科技農企業合作，擴大臺灣農業科技產業規模，提升農業應用科技水準，使與先進國家並駕齊驅，且與國際接軌，以行銷國際。

　　為促進農業科技研發成果商品化、產業化，農科院將加強與本會所屬試驗改良場（所）及學研機構之分工合作及資源共享，除承接前述機 關（構） 之研發成果，並強化與工業、醫藥、資訊及文創等產業之跨域研發合作及加值運用，以提升農業附加價值，引導農業發展新趨勢。