新農業政策為能提升農產加工產業發展，輔導設置區域加工場，透過改善加工製程，申請工廠登記，生產符合食品安全衛生規定之優質加工品，並輔以行銷，拓展市場，進而鏈結並協助小農產銷，穩定發展農業。

• 選擇具一定規模、產能、位於農作物主產區且配合政策之農產加工廠為輔導對象，設置區域型農產品加工場，建立產銷垂直供應體系，以穩定農產品產銷，改善加工設施及產製環境，提高農產品附加價值。2016年完成臺中市沙鹿果菜運銷合作社、南投縣集集鎮蔬果運銷合作社、雲林縣阿丹果菜生產合作社、雲林縣莿桐合作農場、臺南市下營區農會、高雄市大樹區農會等6處區域加工場，加工數量達6千公噸。
• 我國養殖及漁撈技術精良，為避免漁獲豐收時發生魚賤傷漁民的情形，輔導漁業（民）團體依據地區產業需求，設置區域水產品加工場2處，生產符合地區性或季節性特色之安全水產加工產品，開創多元化產品商機，有效處理盛產期之水產品，並促進產業加值與升級，發展漁村經濟，吸引青年漁民返鄉，提高漁業產值創造就業機會。2016年輔導高雄市梓官區漁會水產品加工廠購置加工設備，加速梓官地區水產品加工製作流程。另輔導有限責任臺南市第一漁權會漁業生產合作社購置加工設備，採購臺南當地養殖之虱目魚做為加工主要原料，行銷海內外消費市場，調節魚價並改善養殖漁民生計。
• 為推動農業加值政策，以本會屏東農業生物科技園區（農科園區）為基地，媒合或輔導家禽加工業者進駐，藉以逐步開拓農產加工加值出口外銷等，該園區位處臺灣南部，就近自中南部生產區或畜牧場容易取得相關農產或家禽之原料，設置條件頗佳。配合相關一次性包材裝載雞蛋示範鏈業務推動工作，計畫輔導有關業者、產銷班、農企業評估進駐該園區設置雞蛋集貨物流中心2處，補助自動洗選機、包裝機、洗箱機等設施設備，升級雞蛋使用一次性包材，改善供應運輸方式，開拓雞蛋外銷國際市場。