91 年全力推動各項農業建設，包括水旱田利用調整、產業發展、休閒農漁園區、農漁村建設及產業文化等多項重要計畫，以提升農業競爭力；並加強治山防災，推動全面造林，重視生態保育與環境維護，使台灣農業成為現代化的綠色產業。

　　加強辦理稻米、水果、花生、養豬、家禽及養殖漁業等產業結構調整計畫，以及農業勞動力之調整與訓練等工作。由於我國在入會之前並持續至今積極採行因應對策，加強進口管理，適時啟動特別防衛措施，並密切監視農產品進口與市場價格變化情形，採取短期價格穩定措施，已紓緩部分衝擊。 91 年因天候因素導致多項農產品增產，加以部分農產品進口增加，國內農產價格漲跌互見，其中以二期稻米及水果的價格下跌幅度較大。整體而言，農業受衝擊程度較預期小，農業就業人口反呈小幅增加，緩衝經濟不景氣對國內失業之衝擊。

　　91 年育成紅豆、食用白玉米、楊桃、扁蒲、稻米等優良新品種，並研發農產品種苗繁殖、栽培管理、保鮮貯運等新技術。由國科會、中研院及本會共同補助經費支持「水稻基因組序列分析」研究計畫，完成水稻第 5 條染色體的定序解讀，提升國內生物科技水準。推動設置農業生物技術園區，完成「農業生物技術園區規劃構想」，預訂設立「屏東農業生物技術園區」、台南縣之「台灣蘭花生技園區」及彰化縣之「國家花卉園區」，加速農業生物技術產業發展。推動農業資訊化與知識管理應用，整合農業單位所擁有之生產及經營管理核心知識。執行「農業資訊社群網絡」計畫，累計完成 261 個各級農漁會區域網路系統。推動農民終身學習計畫，並辦理農村青年農業專業訓練，培植優質農業人力資源。

　　加強生產、加工、物流、休閒農業及貿易等聯盟運作，選擇芒果、文旦、東方梨、鳳梨、柑橘、大宗蔬菜等 17 項產業為優先推動項目，輔導組織運作與提升生產技術。整合倉儲、運輸、通路與加工業者等通路資源，建立農產品供應鏈，發揮調節供需功能。篩選優良農特產品 128 項，以「寶島珍品」共同品牌行銷。整合農林漁業資源，架構休閒農業資訊網絡並結合「農業易遊網」，參與國際展覽活動及媒體行銷。透過農業策略聯盟，加強農產品行銷，積極拓展內外銷市場，將芒果、楊桃、蓮霧及大宗蔬菜等農產品擴大輸往新加坡、澳門、香港、加拿大、日本及大陸等市場。

　　為兼顧糧食安全與農業轉型升級，推動「水旱田利用調整後續計畫」，調減稻米、雜糧等保價收購作物生產面積，辦理休耕種植綠肥、翻耕、水源涵養等措施，或輔導輪作地區性特產。其他農糧產業基於市場導向、適地適作原則，發展精緻農業，以種苗、花卉、外銷蔬菜、新鮮菇類、熱帶水果等為發展重點。另輔導發展農村食品加工事業，利用地區性農特產原料，開發具地方特色之農特產加工品，提高農產品附加價值。

　　92 年起，我國稻米進口方式由限量進口轉換為關稅配額制度。本會已研擬產業因應調整及價格穩定措施，將視市場榖價變動情形，適時啟動價格穩定措施，當產地稻穀價格低於直接生產成本每公斤 15.2 元時，將給予稻農現金救助，以保障稻農收益。

　　推動國際漁業合作與責任制漁業，維護漁船作業權益，強化遠洋漁業管理，落實遠洋漁業資源保育與經濟利用並重。推動漁業多元化建設，調整漁業生產結構，並發展海上箱網養殖、海水養殖、水產種苗、觀賞魚等科技型養殖。擬定漁業動力用油優惠油價調整措施及漁船收購計畫，配合輔導漁民轉營海洋養殖、休閒及娛樂漁業，以符合 ＷＴＯ規範、永續利用漁業資源及兼顧漁民權益。建構海洋牧場及生態休閒走廊，投放軍艦礁及電桿魚礁，強化漁業資源復育與管理，引導漁業朝多元化及生態、環境、保育方向發展。

　　調整畜禽產銷體系，輔導辦理統合經營及策略聯盟，結合產、製、銷一體之行銷網路，強化畜禽產銷穩定及市場調節之能力。加強國產畜禽產品之認證及行銷，建立「台灣珍豬」、「鮮乳標章」、「台灣土雞」等共同標誌，塑造國產畜禽產品優良形象。獎勵輔導設立液蛋加工廠，促進蛋品多元化與強化調節雞蛋產銷之能力。辦理牛羊產業結構調整計畫，獎勵不具競爭力酪農戶離牧。推廣牧場減廢及資源再利用，解決畜牧場污染問題。加強動物保護，強化流浪犬之收容管理，並結合民間力量，落實動物保護工作。

　　健全農產品運銷體系，強化通路整合力量，加強產銷調節，有效穩定農產品價格。推廣優良農產品品牌，推動品牌水果認證。建立農產品批發市場經營績效指標，推動健全交易制度。輔導農民團體充實預冷、清洗、包裝及冷藏運輸設備，建立現代化作業場。協助國產農產品拓展國外市場，委請中華民國對外貿易發展協會規劃、組團參加國際性農產品展覽，並針對有外銷潛力的農產品，改進包裝設計，塑造台灣精緻農產品形象。

　　我國加入ＷＴＯ後，進口農產品的種類及數量大幅擴增，使疫病蟲害發生的風險增加。本會持續加強動植物防疫檢疫，建構完善之動植物疫情監測體系，並成立走私農產品鑑定小組，配合加強農產品緝私工作，以防杜重要疫病蟲害入侵。加強畜禽產品藥物殘留監控、抽驗、追?及管理，強化屠宰衛生及肉品檢查制度，維護農業生產與消費之安全。

　　妥善處理美國蘋果蠹蛾事件，並針對狂牛病、狂犬病、禽流感等疫病進行監測，維護我國為該等惡性傳染病之非疫區。我國發生豬隻口蹄疫後即積極推動各項防疫措施，加速撲滅口蹄疫，至 92 年 2 月 26 日已屆滿 2 年無疫情，已向世界動物衛生組織(ＯＩＥ)申請認定為「使用疫苗之口蹄疫非疫國」，並持續加強各項措施，使台灣早日成為口蹄疫非疫區。

　　輔導農、漁會推展事業，補助信用部被接管農漁會之相關業務經費，並支助執行振興計畫。研擬完成「農業金融法」草案，經陳報行政院審查後，於 92 年 1 月 8 日送請立法院審議，以健全農漁會信用業務體系、改善農漁會信用部經營體質、加強農漁會信用部業務規範，及持續推動農漁會信用部改革。建構農村聚落居民生活照護支援體系，及輔導農家經營田園料理與家事服務，開創新收入來源。持續辦理農業天然災害救助、發放老年農民福利津貼、農漁民第二專長訓練，並加強農業金融服務。

　　推動「農村新風貌」計畫，落實由下而上之「社區總體營造」理念，以農村社區居民為核心，兼顧產業經濟、文化發展與環境保護，改善農村環境，辦理農村綜合發展規劃及建設、農村新生活圈、農宅輔建與產業多元化活動，及加強原住民地區發展，促進城鄉均衡發展。推動休閒農漁園區計畫，將農業產業資源、田園景觀與休憩資源互相結合， 91 年補助 15 個縣 99 個鄉鎮推動休閒農業，在農漁村建設 550 個休憩景點，活絡農村經濟與創造就業機會。

　　加強坡地防災整治，辦理崩塌地及土石流潛勢溪流調查，並落實山坡地管理。已完成土石流防災應變、網際網路地理資訊及工程管考等 3 大系統，於颱風豪雨期間可即時分析土石流警戒情形，並提供各項防災資訊。加速崩塌裸露地植生復育，發揮國土保安及穩定坡面之功效。加強區域性水土保持處理與維護，保育山坡地水土資源。推動 921 震災復建計畫，加強土石流防治、崩塌地處理、緊急災害處理等水土保持工作。

　　辦理全民造林及國、公有地造林工作，推動平地造林，將綠化的範圍延伸至平地、都市周邊及海岸地區，並結合社區力量，永續發展林業。推展森林生態旅遊，整合全島原有山區步道，提供豐富的生態之旅。加強推動「野生動物保護法」、「文化資產保存法」及「生物多樣性推動方案」，落實生物多樣性之維護。加強農田水利建設，辦理農田水利設施更新改善，推動圳路綠美化及生態工法，推廣省水灌溉，並強化農田水利會監督輔導。

　　強化國際農業合作，積極參與ＷＴＯ與ＡＰＥＣ等國際組織之農業相關活動，並推動台泰、台越、台荷、台加、台美等雙邊農業合作。推動兩岸農業交流，採循序漸進作法，優先推動調整農產貿易與投資項目、農業資訊合作，強化安全機制及拓展國產農產品大陸市場；中長程將共同防制農產品走私、處理漁事糾紛及維護漁業資源，並擴大農產貿易與投資，促進雙方產業分工。

　　「農業發展條例」部分條文修正案於 92 年 2 月 7 日公布施行，修法重點為合理放寬農地利用限制，促進農地有效利用及得以排除公共債務法之限制，未來政府將分 3 年編列預算補足農產品受進口損害救助基金 1,000 億元。為落實執行該條例，需增修訂之相關子法規共13種，正積極辦理中。另外，積極推動「農業金融法」、「農業合作社法」等重要農業法案早日完成立法，提升施政效能。