本會89年度施政，係依據行政院所頒施政方針，訂定施政計畫，繼續推動「跨世紀農業建設方案」，加強科技研發、資訊應用，並規劃推動農業策略聯盟，發展食品加工業，致力提升農產業競爭力；透過整合性農漁村建設計畫，提高農漁民生活品質；藉由全面性生態保育措施，提升環境品質，以因應總體環境變遷，促進本土農業發展。

　　中華民國年度施政方針係由行政院審度國家整體發展需要，通盤衡量國家可用資源而訂定。89年度有關農業建設之施政方針包括以下10項：

(一)因應加入世界貿易組織，提升農業產品競爭力，整合農業科技研發，全面改善農業體質，發展高品質、多樣化之農畜產品，促進農業永續發展。

(二)放寬農地農有，落實農地農用，健全農地利用管理機制，防止農地炒作。

(三)調整稻米產業結構，建立糧食均衡產銷體系，加速推動水旱田輪作制度，推廣良質米產銷，強化稻米分級檢驗。

(四)整建動植物檢疫、防疫體系，加強進口農產品檢疫、國外疫區與原產地檢疫查證及其產品之進口管制，突破農產品外銷檢疫障礙；撲滅重大動植物疫病蟲害，加強用藥安全管理及肉品屠宰衛生檢查，落實藥物殘留監控，確保民眾食用安全。

(五)改進土石流監測系統，加強山坡地管理，落實治山防災；繼續強化野生動植物與自然景觀之保育，確保生物多樣性；合理利用農業水資源。

(六)推動國際責任漁業，發展栽培漁業、水產種苗及箱網養殖事業；獎勵漁船汰建，提升經營效率，促進漁港功能多元化；參與國際漁業組織，拓展對外漁業合作。

(七)擴大辦理動物保護工作，建立畜犬與流浪犬之管理制度。

(八)擴展農業資訊體系，整合農漁民團體之通路資源，強化直銷體系，輔導建立農產品品牌及低溫保鮮物流體系，營造運銷優勢。

(九)建設富麗農漁村，加強照顧老年農漁民；積極推展農漁產業文化，發展休閒農漁業，改善農漁民生活品質，提升農漁村活力。

(十)推動互利互惠之國際農業合作，提升我國農業科技水準，協助友邦發展農業。

　　本會依據行政院89年度施政方針，衡酌整體經濟與農業發展情勢，配合核定之預算額度，編訂89年度施政計畫，其要點及重大施政目標如次：

(一)發展科技化、資訊化、品牌化之農業：研發農業生物技術及重點產業科技，推廣產銷自動化，應用遙測與資訊技術管理農場，提昇產業競爭力；建立農業產銷資訊系統，強化產銷預警制度，奠定產銷利基；建立農產品品牌及品質認證制度，推展優良農產品標誌，建立國產農產品低溫保鮮物流系統，規劃建置農產品網路商城，拓展行銷通路；調整產業結構，推動適地適作，發展具高附加價值與市場潛力的產業，建立糧食安全體系。

(二)加強動植物防疫檢疫，確保農產品衛生安全：建立種子、種苗特定疫病蟲害檢查制度，籌建動植物隔離檢疫中心，健全動植物防疫檢疫體系；加強動物疫病防治，辦理寵物登記及保護宣導，改善流浪犬收容處理，落實動物保護法；推廣安全用藥與吉園圃認證制度，加強畜禽屠宰衛生檢查及畜禽產品藥物殘留防範與監控，確保農產品衛生安全。

(三)輔導農漁民團體及產銷組織經營現代化：強化農漁民團體服務功能，促進農業金融系統穩健經營，輔導產業自治，發揮產銷自主調節功能；培育核心農民及農業推廣人才，建立經營管理顧問專家診斷輔導體制，提昇產銷班經營效率。

(四)強化社區意識，營造祥和農漁村社會：推動農漁村社區綜合建設，推廣產業文化，規劃設立國家農業博物館；促進漁港功能多元化，善用農漁村整體資源，輔導發展休閒農漁業；加強離島農業建設，均衡區域發展。

(五)健全農漁村社會安全體系，提昇農漁民福祉：擴大發放老年農漁民福利津貼，加強老年農漁民安養照顧；辦理農漁業救助及補貼，減輕農漁民損失與成本負擔；辦理農漁民第二專長訓練，培植轉業能力。

(六)維護物種多樣性，加強水土資源保育：加速生物資源調查，推動全民造林運動，加強森林經營，落實棲地管理與野生動植物保育；加速劃設特定水土保持區、改善農路，應用遙測技術加強山坡地監測，健全山坡地管理制度，落實治山防災；改善農田水利設施，維護及調配灌溉用水；發展有機農業，推廣合理化施肥；推動責任制漁業，善盡國際資源共同養護責任；加強畜牧污染管理，推行畜牧場減廢與廢棄物資源化利用。

(七)加強對外農業合作，促進農業交流：積極參與國際組織及活動，強化國際農業諮商與貿易，推展與先進國家之農業科技合作，落實南向政策及與中南美、非洲友邦之農業合作；促進兩岸農業科技、種原及人才交流，建立兩岸漁事糾紛調處機制。